酵素の、非タンバク質部分を形成する比較的小さな分子の化合物で、この補酵素を必要とする酵素は、補酵素がないと活性化しない。
ビタミンB1、B2、ナイアシン、パントテン酸、ビタミンB6、それに鉄なども補酵素と考えられている。ビタミンB1が糖質代謝に必要なものとして注目されているのは、その補酵素の役割が大事だからである。補酵素はコエンザイムとか、コエンチームとかいわれることもある。